ГЕНЫ-КАНДИДАТЫ, СВЯЗАННЫЕ С ШИРИНОЙ ГРУДИ У ОВЕЦ ПОРОДЫ РОССИЙСКИЙ МЯСНОЙ МЕРИНОС

Аннотация

Полногеномный поиск ассоциаций (GWAS, Genome‐ Wide Association Study) в последнее время широко применяется в области генетики и селекции сельскохозяйственных животных. Исследования направлены на выявление вариантов в геномных локусах, связанных с определёнными признаками в популяции, в частности на выявление ассоциаций между распространёнными однонуклеотидными полиморфизмами (single nucleotide polymorphism, SNP) и продуктивными качествами у животных. В работе представлены результаты исследований, посвящённых поиску однонуклеотидных замен и генов-кандидатов, связанных с шириной груди у баранчиков породы российский мясной меринос. Объектом исследования служили клинически здоровые животные (n = 50). Экспериментальная работа проводилась в СПК «Племенной завод Вторая Пятилетка» Ипатовского района Ставропольского края. Генотипирование животных выполнялось с использованием Ovine Infinium HD BeadChip 600K согласно протоколу производителя. Контроль качества генотипирования проводился с использованием программного обеспечения PLINK V.1.07. Для картирования SNP использовали сборку генома Ovis_Aries_3.1. В результате проделанных исследований нами обнаружено 13 однонуклеотидных полиморфизмов, ассоциированных с шириной груди у годовалых баранчиков. Локализованы полиморфизмы на 18, 3, 16, 6, 1, 2, 4 хромосомах. Определение местоположения замен даёт возможность обнаружить 11 геновкандидатов (LINGO1, ANKS1B, ENSOARG00000006105, CFI, USP33, IFI44, ENSOARG00000025572, TMPRSS15, ARHGEF26, ENSOARG00000014626, UPP1), связанных с шириной груди. Белковые продукты генов участвуют в важных внутриклеточных и физиологических процессах. Дальнейшие исследования позволят подтвердить влияния предложенных генов-кандидатов на фенотип, а также детально рассмотреть их структуры с целью изучения мутаций, вызывающих изменения фенотипа у баранчиков породы российский мясной меринос.