ПОИСК ГЕНОВ-КАНДИДАТОВ, АССОЦИИРОВАННЫХ С ВЫСОТОЙ В ХОЛКЕ У ОВЕЦ ПОРОДЫ ДЖАЛГИНСКИЙ МЕРИНОС

Авторы

  • А.Ю. Криворучко ФГБНУ СК-ФНАЦ
  • Т.Ю. Саприкина ФГБНУ СК-ФНАЦ
  • О.А. Яцык ФГБНУ СК-ФНАЦ
  • А.А. Каниболоцкая ФГБНУ СК-ФНАЦ

DOI:

https://doi.org/10.25930/2687-1254/010.1.14.2021

Ключевые слова:

овцеводство, джалгинский меринос, полногеномный поиск ассоциаций, однонуклеотидные замены, GWAS, SNP, гены-кандидаты.

Аннотация

Полногеномный анализ ассоциаций является современным и мощным инструментом, позволяющим идентифицировать полиморфизмы и локусы, связанные с хозяйственно-значимыми признаками продуктивных животных. Актуальным является поиск генетических маркеров, относящихся к особенностям экстерьера. В статье представлены данные, полученные при проведении полногеномного поиска ассоциаций для показателя «Высота в холке» у овец породы джалгинский меринос. Генотипирование животных проведено с использованием ДНК-биочипов OvineInfinium
HD BeadChip 600K. Контроль качества генотипирования, а также полногеномный анализ ассоциаций выполнен с использованием программного обеспечения PLINK V.1.07. Визуализация и построение графиков производились с помощью пакета «QQman» на языке программирования «R». В результате проделанной работы выявлено пять однонуклеотидных замен, преодолевших порог достоверности – log10(p) = 5. Полиморфизмы rs417213266 и rs406848373 расположены в области интронов белоккодирующих генов, замены rs400877889, rs425204656, rs402179120 – в межгенных
областях. Наибольший уровень достоверности ассоциаций выявлен для полиморфизма rs417213266, находящегося на первой хромосоме. На основании проведенных исследований предложено 6 новых генов-кандидатов, ассоциированных с высотой в холке у овец породы джалгинский меринос: OLFML2B, RIMS2, CAAP1, LOC105612031, SF3B5, STX11. Перечисленные гены выполняют ряд важных биологических функций, в том числе участвуют в регуляции обменных процессов. Дальнейшие исследования должны быть направлены на подтверждение влияния предложенных генов-кандидатов на фенотип животных, а также на доказательство связи полиморфизмов rs417213266, rs406848373, rs400877889, rs425204656 и rs402179120 с экстерьерными показателями овец.

Загрузки

Опубликован

22-09-2021

Как цитировать

Криворучко, А., Саприкина, Т., Яцык, О., & Каниболоцкая, А. (2021). ПОИСК ГЕНОВ-КАНДИДАТОВ, АССОЦИИРОВАННЫХ С ВЫСОТОЙ В ХОЛКЕ У ОВЕЦ ПОРОДЫ ДЖАЛГИНСКИЙ МЕРИНОС . Сельскохозяйственный журнал ISSN (Print): 2687-1246, ISSN (Online): 2687-1254, 14(1). https://doi.org/10.25930/2687-1254/010.1.14.2021

Выпуск

Раздел

БИОЛОГИЧЕСКИЕ НАУКИ

Наиболее читаемые статьи этого автора (авторов)